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生产用菌种，经长期使用和保藏后，会发现发酵单位低、产生泡沫多、菌丝变形等异常现象，这标示着菌种的退化，导致菌种质量低劣，应用该菌种会直接影响发酵生产，菌种质量是影响发酵成败的关键因素之一。针对菌种质量这一问题，结合菌种本身的特征及菌种制备的方法和条件，对已退化的菌种进行处理，恢复该菌种原有优良性状，是保证生产稳定性的基础。现以细菌为例进行探讨。