广西巴马小型猪CTSK基因CDS区克隆与生物信息学分析

• 作 者: 黄叶 瞿秋红 奉玲丽 江雨航 朱思燃 张广杰 张其伟 綦文晶
• 机 构: 广西大学动物科学技术学院
• 出 处: 中国实验动物学报
• 发表日期: 2019年1期
• 关键词: CTSK基因 广西巴马小型猪 克隆 CTSK gene Guangxi Bama mini-pig cloning
• 基金项目: 国家自然科学基金项目(81860150)

目的对广西巴马小型猪组织蛋白酶K(cathepsinK,CTSK)基因CDS区进行克隆及生物信息学分析。方法从广西巴马小猪的皮下脂肪中提取总RNA,通过RT-PCR方法扩增获得CTSK基因CDS区序列,并采用相关生物信息学软件对其序列特征、系统进化、编码蛋白结构和理化性质进行分析。结果广西巴马小型猪CTSK基因CDS全长993bp,编码330个氨基酸,与NCBI上公布的普通猪(NM_214302.1)CTSK基因序列完全一致。同源性比对结果发现,CTSK基因在进化过程中具有较高的保守性。广西巴马小型猪CT