A molecular dynamics simulation study of peptide deformylase from Leptospira interrogans complex：Exp

• 作 者: Qiang Wang Jian Wu Wang Zheng
• 机 构: InstituteofTheoreticalChemistry,InstituteofOrganicChemistry,TianjinInstituteofthePharmaceuticalResea
• 出 处: 中国化学快报：英文版
• 发表日期: 2008年4期
• 关键词: 缩氨酸去甲酰化 螺旋体 分子动态模拟 晶体结构分析 Peptide deformylaseLeptospira interroganMolecular dyna
• 基金项目: AcknowledgmentsThe authors acknowledge the supports of the National Key Basic Research Priorities Program （No. 2003CCA027） and the National Natural Science Foundation of China （No. 20573064）.

探索底层衣袋的关门机制，我们从螺旋体 interrogans 在 ligand 免费、 actinonin 固定的肽 deformylase 上独立执行 16,000 ps 分子动态学模拟。我们 CD 环，吸水的禁止者和恐水病的簇为半开的符合构造的形成是必要的结果表演，和 Tyr71 在调停起一个重要作用 CD 环的运动。actinonin 固定的 LiPDF 建筑群的平均 MD 结构来临到晶体结构。这些与实验一致很好。