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神经系统内Ｚｎ＾２＋主要位于端脑边缘系统，尾壳核及大脑皮层，并呈亚区分布，端脑内含Ｚｎ＾２＋纤维系统形成庞大网络，使得同型皮质，异型皮质和边缘系统相互联系，突触泡内与谷氨酸共存并以Ｃａ＾２＋依赖性和脉冲依赖性方式释放的Ｚｎ＾２＋可被组化方法原位检出（约占含Ｚｎ＾２＋总量的１０％）神经系统内Ｚｎ＾２＋的主要功能可能与神经递质的贮存，神经系统发育以及神经兴奋性调节有关。