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为了促进中西医结合学在临床、教学、基础研究等方面的发展，首都医科大学集中17所医院及单位的力量于2007年率先成立了北京第一个中西医结合学系，并于2008年4月12日上午正式挂牌。揭牌仪式在首都医科大学附属北京友谊医院门诊楼报告厅举行，友谊医院名誉院长王宝恩为首任系主任。北京市卫生局、北京市教委、北京市中医药管理局、中国中西医结合学会、首都医科大学、北京友谊医院等相关领导及有关人士出席了揭牌仪式。仪式由首都医科大学副校长王晓民主持。