【摘 要】
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目的 对结膜吸吮线虫分泌蛋白基因组数据进行注释分析,筛选出富亮氨酸结构域蛋白,分析预测该基因序列及其编码蛋白质的结构和功能. 方法 对结膜吸吮线虫基因组进行结构分析和
【机 构】
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遵义医学院寄生虫学教研室,贵州遵义563000;贵州省教育厅基因检测与治疗特色重点实验室;遵义市公安局新蒲分局;中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所
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目的 对结膜吸吮线虫分泌蛋白基因组数据进行注释分析,筛选出富亮氨酸结构域蛋白,分析预测该基因序列及其编码蛋白质的结构和功能. 方法 对结膜吸吮线虫基因组进行结构分析和注释,在分泌蛋白组中筛选富亮氨酸结构域蛋白基因序列,利用ExPASY、DNAstar、MEGA 7.0等生物信息学软件预测分析其编码蛋白的理化性质、抗原表位等,并进行同源序列比对分析;建立系统发育树,进行系统进化分析. 结果 从结膜吸吮线虫分泌蛋白组中筛选出 1条含有完整编码框的富亮氨酸结构域蛋白基因序列,其长度为2 439 bp,编码812个氨基酸.编码蛋白相对分子质量(Mr)为204.001 24×103,为疏水性蛋白,含一个信号肽,无跨膜区,且含有较多抗原表位,与盘尾丝虫同源序列相似性为66％. 结论 生物信息学分析结膜吸吮线虫富亮氨酸结构域蛋白含有抗原表位,故该蛋白及其编码基因序列可作为诊断抗原和疫苗候选分子,也为该蛋白的功能研究了提供基础数据.
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