【摘 要】
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目的:基于GitHub上释放的野葛转录组序列和miRBase中的microRNAs(miRNA)数据,通过生物信息学方法预测野葛中保守的miRNA,为研究其在野葛中的生物学作用奠定基础。方法:根据mi
【机 构】
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中草药物质基础与资源利用教育部重点实验室/中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京市海淀区植物组织培养技术实验室,湖北省农业科学院中药材研究所
【基金项目】
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国家自然科学基金(81274015);恩施州科技计划研究与开发项目(XYJ2016000305)
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目的:基于GitHub上释放的野葛转录组序列和miRBase中的microRNAs(miRNA)数据,通过生物信息学方法预测野葛中保守的miRNA,为研究其在野葛中的生物学作用奠定基础。方法:根据miRNA在植物中的保守性,利用psRobot软件的前体预测模块“psRobot-mir”将miRBase数据库中已知的miRNA序列与野葛转录组序列进行比对,按照miRNA的判定标准进行筛选,并随机选取了7条miRNA进行茎-环PCR验证,随后利用psRNATarget软件对这些miRNA进行了靶基因预测。结果
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