【摘 要】
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甲肝病毒(hepatitis A virus,HAV)是能引起传染性甲型肝炎的单链RNA病毒.用常规RT-PCR(反转录PCR)和SYBR Green实时定量RT-PCR方法,根据甲肝病毒保守的VP1-VP2基因序列设计引
【机 构】
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南开大学微生物学系生物活性材料教育部重点实验室,天津出入境检验检疫局,南开大学环境科学与工程学院,中国人民武装警察部队医学院天津市职业与环境危害生物标志物重点实验室,
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甲肝病毒(hepatitis A virus,HAV)是能引起传染性甲型肝炎的单链RNA病毒.用常规RT-PCR(反转录PCR)和SYBR Green实时定量RT-PCR方法,根据甲肝病毒保守的VP1-VP2基因序列设计引物,对渤海湾天津沿岸海水中的甲肝病毒进行了检测和定量分析.9个样品取自渤海湾天津塘沽以南沿岸海水,取样时间分别是2007年夏、秋、冬季和2008年春季.海水样品先用小型超滤装置(Millipore Pellicon Mini TFF)或超滤离心管(Millipore Centricon Plus-70)浓缩,然后进行RT-PCR检测.结果表明,从9个海水样品中都能扩增出192 bp的HAV cDNA,这些cDNA的核苷酸序列与GenBank中的同源序列相似性为95%~100%.用SYBR Green实时定量RT-PCR检测了春季和冬季的6个海水样品,结果表明,海水中甲肝病毒的浓度范围为5.35×106~4.51×107virus particles/L.
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