鼠伤寒沙门菌伴侣蛋白Hfq调控基因的筛选

• 作 者: 潘永 李晨 杨阳 刘丽娟 杨琦
• 机 构: 贵州大学动物科学学院,贵州省畜禽资源遗传管理站,贵州大学动物疫病研究所,贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室,都匀市农业农村局
• 出 处: 中国预防兽医学报
• 发表日期: 2020年7期
• 关键词: 鼠伤寒沙门菌 伴侣蛋白Hfq 致病机制 ABC转运通路 群体感应 Salmonella typhimuriumchaperone protein Hfqpath
• 基金项目: 国家自然科学基金(31760740),国家自然科学基金(31602065),贵州省科技厅联合资金项目贵州大学2017年度学术新苗培养及创新探索专项[黔科合LH字(2017)7263、黔科合平台人才(2017)5788],贵州省科技厅基金[黔科合基础(2016)1047],贵州省研究生教育创新计划项目(GZZ2017002)

为筛选鼠伤寒沙门菌伴侣蛋白Hfq所调控的基因,本实验基于本研究室前期对指数生长期和稳定期的鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株转录组测序结果,从中随机挑选6个在转录水平差异表达的基因,并通过荧光定量PCR技术验证转录组数据的可靠性,然后在转录组数据可靠的前提下将两个转录组中所有显著差异表达(log2FoldChang>1)的基因GO富集细菌致病机制生物学过程,Pathway富集细菌ABC转运通路和群体感应通路,在富集得到的基因中筛选指数生长期和稳定期均表现为转录水平差异表达且趋势相同的基因。荧光定量PCR检