【摘 要】
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为研究高粱HIR基因家族成员的表达特性,采用生物信息学分析方法和实时荧光定量(qRT-PCR)技术,对高粱HIR基因家族进行鉴定和分析。结果表明:高粱中有5个HIR成员(SbHIR1~SbHIR5),分布于高粱第2、3、7、9、10号染色体上;系统进化分析发现高粱与玉米的亲缘关系最近;不同物种间及物种内HIR基因的有效密码子数相对保守;基因结构分析表明,高粱HIR基因内含子数为1~6个;Motif分析表明,高粱SbHIR2蛋白缺失Motif 5和Motif 8,其余高粱HIR成员均具有9个Motif;高粱
【机 构】
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贵州大学农学院农业微生物特色重点实验室,国家小麦改良中心贵州分中心,贵州大学绿色农药与农业生物工程教育部重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金(32060614),贵州省科技计划(黔科合支撑[2019]2408号/黔科合成果[2019]4246),贵州省特色杂粮现代农业产业技术体系(GZCYTX 2018-04-3)。
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为研究高粱HIR基因家族成员的表达特性,采用生物信息学分析方法和实时荧光定量(qRT-PCR)技术,对高粱HIR基因家族进行鉴定和分析。结果表明:高粱中有5个HIR成员(SbHIR1~SbHIR5),分布于高粱第2、3、7、9、10号染色体上;系统进化分析发现高粱与玉米的亲缘关系最近;不同物种间及物种内HIR基因的有效密码子数相对保守;基因结构分析表明,高粱HIR基因内含子数为1~6个;Motif分析表明,高粱SbHIR2蛋白缺失Motif 5和Motif 8,其余高粱HIR成员均具有9个Motif;高粱
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