Optimization of CHARMM force field parameters for the chalcone fragment

• 作 者: ZHANG Hui YAO Yuan QI XiaoLi L
• 机 构: CollegeofChemicalandEnvironmentalEngineering,AcademyofFundamentalandInterdisciplinarySciencesDepartm
• 出 处: 中国科学：化学英文版
• 发表日期: 2012年12期
• 关键词: 力场参数 参数优化 查耳酮 从头计算方法 相互作用能 模型化合物 分子内环化 查尔酮 CHARMM force field parameters chalc
• 基金项目: We thank Doctor Niu Huang （National Institute of Biological Science, Beijing 102206, China） for his fruitl discussions and Andrew Christof ferson for checking the English. This work was supported by t

在这个工作，我们为非标准的生物残余 chalcone 开发了 CHARMM 所有原子力量域参数，为 CHARMM27 力量域开发由标准协议列在后面。目标数据在 MP2/6-31G 经由 ab initio 计算被产生 * 并且 HF/6-31G * 层次。参考数据包括了在水和模型混合物 F (chalcone 的碎片) 之间的相互作用精力。邦德，角度，和扭转参数从 ab initio 计算被导出并且重新使正常化与标准残余的存在 CHARMM27 参数维持相容性。优化 CHARMM 参数表现很好在复制目标数