【摘 要】
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利用第二代高通量测序技术对高原鼢鼠(Eospalax baileyi)大脑组织进行转录组测序,筛选微卫星标记,分析其组成与特征,并检验其多态性,为高原鼢鼠微卫星标记的开发及后续研究等奠定基础.结果 发现:在获得的29090个微卫星标记中单核苷酸重复A/T是重复次数最多的类型(54.31%),其次为二碱基重复CA/TG (10.46%),其他碱基重复类型仅占16.79%.随机选取104个微卫星位点进行引物设计,发现有43个位点扩增成功.12个多态性位点经毛细管电泳检测发现,等位基因数为3~12个,观测杂合度
【机 构】
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甘肃农业大学草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/中-美草地畜牧业可持续发展研究中心,甘肃兰州730070;甘肃农业大学-新西兰梅西大学草地生物多样性研究中心,甘肃兰州730070;甘肃农业大学草业
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利用第二代高通量测序技术对高原鼢鼠(Eospalax baileyi)大脑组织进行转录组测序,筛选微卫星标记,分析其组成与特征,并检验其多态性,为高原鼢鼠微卫星标记的开发及后续研究等奠定基础.结果 发现:在获得的29090个微卫星标记中单核苷酸重复A/T是重复次数最多的类型(54.31%),其次为二碱基重复CA/TG (10.46%),其他碱基重复类型仅占16.79%.随机选取104个微卫星位点进行引物设计,发现有43个位点扩增成功.12个多态性位点经毛细管电泳检测发现,等位基因数为3~12个,观测杂合度(Ho)为0.263~0.937,平均值为0.651,期望杂合度(He)为0.285~0.844,平均值为0.600.使用Bonferroni校正后,有2个微卫星位点显著偏离哈迪-温伯格平衡(P<0.01),10个微卫星位点未观察到显著的连锁不平衡(P>0.01).多态信息含量(PIC)在0.251~0.816,全部为中度多态性(0.250< PIC< 0.500)以上的位点,且有7个微卫星位点表现为高度多态性(PIC> 0.500).这些微卫星标记为高原鼢鼠的亲权关系鉴定、种群遗传学等研究提供了基础数据.
其他文献
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为确定饲草谷子(Setaria italica)调制青贮的最适生育期,本研究采用随机区组设计,选用\'118\'饲草谷子为供试品种,分别在其灌浆期、乳熟期和蜡熟期时收获,调制成小包装青贮饲料,厌氧发酵60 d后,对比其营养成分、发酵品质和微生物组成.结果 表明:1)随着生育期的推进,青贮饲料中的干物质含量逐渐增加,然而粗蛋白质和可溶性碳水化合物含量呈降低趋势,乳熟期的可溶性碳水化合物含量较高.2)青贮后,乳酸菌的数量有所增加,其中乳熟期处理组数量最多,各处理组中均存在一定数量的霉菌、酵母菌和一般好
为构建高效表达的内切葡聚糖酶基因工程菌,本研究以牛瘤胃液中微生物全基因组为模板,通过PCR扩增方法得到eg片段,将其克隆至表达载体pMG36e中获得分泌型表达载体pMG36e::eg;将测序正确后的重组质粒电转导到乳酸菌(Lactococcus lactis NZ9000)中,得到L.lactis NZ9000/pMG36e::eg重组菌株,将发酵上清液通过10%三氯乙酸(Trichloroacetic acid,TCA)/丙酮沉淀法浓缩蛋白后,用刚果红染色法和3,5-二硝基水杨酸(3,5-Dinitro
本研究以福建典型的红壤丘陵山区锥栗(Castanea henryi)园为研究对象,采用随机区组设计,将供试样地分为面积0.3~0.5 hm2的若干试验小区,全园清除自然杂草后,设置撒播鼠茅草(Vulpia myuros,VM)籽、光叶紫花苕(Vicia villosa,VV)籽、黑麦草(Lolium perenne,LP)籽、紫云英(Astragalus simicus,AS)籽和园叶决明(Chamaecrista rotundifolia,CR)籽5种生草栽培,以及清耕(CT)和喷施草甘膦(GS),共7
研究旱地雨养农业区间作系统对土壤水分和根系形态构建的影响对进一步理解间作系统高效高产具有重要意义.选用不同玉米(Zea mays)(郑单958M1和豫玉22 M2)和大豆(Glycine max)品种(中黄24 S1和中黄13 S2)以2行大豆2行玉米种植比例进行间作(M1S1,M1S2,M2S1和M2S2),研究间作对作物产量、作物根系形态和土壤含水量的影响,探讨根系形态和土壤含水量之间的关系.结果 表明:M1S1间作的产量高于其他间作.M1S1间作玉米的根表面积密度、根体积密度和根重密度分别较M2S1
将新鲜绿狐尾藻(Myriophyllum elatinoides)、稻(Oryza sativa)秸粉和玉米(Zea mays)粉按质量比70%:15%:15%混合作为青贮原料,分别添加纤维素酶、木聚糖酶和复合纤维素酶3组添加剂,以未添加为对照,研究不同酶制剂对绿狐尾藻混合青贮发酵品质、营养品质及有氧稳定性的影响.结果 表明:与未添加对照相比,添加酶制剂可显著降低绿狐尾藻混合青贮的pH和氨态氮/总氮(P<0.05),显著提高可溶性碳水化合物含量(P<0.05);复合纤维素酶处理组感官评分和V-Score评
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为了缓解西藏高寒牧区冬春季节蛋白草料营养不足的问题,通过田间试验对12份野生豆科牧草种质资源生产性能及营养价值进行研究,并应用主成分分析法、隶属函数分析法、灰色关联分析法、相似优先比分析法4种评价模型对野生豆科牧草种质资源进行综合评价.结果 表明:供试的12份西藏野生豆科牧草在林芝地区的适应性差异较大,其中山野豌豆(Vicia amoena)生育期最长(174 d),干草产量最大(4665.89 kg·hm-2);\'羌纳\'西藏野豌豆(V.tibetica\'Qiangna\')的株高最
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