【摘 要】
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通过对美国华盛顿洲在2020年3至4月底爆发的新冠肺炎病人二代高通量测序数据分析,找出新冠病毒刺突糖蛋白(简称S朊)中存在的所有突变类型,为研究病毒在体内复制的突变规律及
【机 构】
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南京普维康生物科技有限公司,中国石油大学（北京）油气资源与探测国家重点实验室地层微生物资源与应用研究中心非常规油气科学技术研究院,华北理工大学实验动物中心,中国科学院生态环境研究中心
【基金项目】
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科技新星和领军人才培育计划项目(Z161100004916033),中国石油大学(北京)前瞻导向项目(ZX20190209),中国石油天然气集团有限公司-中国石油大学(北京)战略合作科技专项(ZLZX2020010805,ZLZX2020020405)
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通过对美国华盛顿洲在2020年3至4月底爆发的新冠肺炎病人二代高通量测序数据分析,找出新冠病毒刺突糖蛋白(简称S朊)中存在的所有突变类型,为研究病毒在体内复制的突变规律及研究疫苗提供基础资料。利用NCBI中公布的130例美国华盛顿区报道的新冠肺炎病人二代高通量测序数据,进行序列组装,并对其朊编码基因进行深度突变分析,找出其潜在的疑似抗原变异位点(antigen variation,以下简称突变点)。排除30条未获全长的数据,共获得100份病人完整的SARS CoV 2序列,其S朊编码基因,主要突变点集中在
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