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上海生命科学研究院蛋白质组学重点实验室研究方向主要是蛋白质组学,包括功能蛋白质组分析、蛋白质结构生物学和蛋白质组信息生物学.将蛋白质的表达(功能蛋白质组表达差异分析)、蛋白质的功能(蛋白质相互作用和功能分析)和蛋白质的结构(蛋白质功能的结构基础)三个层面的研究有机结合起来,探讨细胞分化、神经发育、药物成瘾中的基本生物学问题,为研究、诊断、防治肿瘤和神经系统等人类重大疾病服务.