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保护区是重要的物种基因库和科学研究、环境监测基地。区内有2543种野生植物,其中长白松,东北红豆杉属国家一级保护植物,红松、朝鲜崖柏、紫椴等9种植物为国家二级保护植物。区内有1300余种昆虫,306种脊椎动物,其中东北虎、紫貂、中华秋沙鸭等7种动物属国家一级保护动物,黑熊、花尾榛鸡37种动物属国家二级保护动物。