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植物基因组学国家重点实验室以"面向世界科技前沿、面向经济主战场、面向国家重大需求"为原则,以国家粮食安全和农业可持续发展为己任,面向植物科学发展的国际前沿,坚持顶层设计,发挥"新举国体制"的优势攻关重大科学技术问题。主要研究方向为植物基因组的结构与调控、重要农艺性状的功能基因组学、植物激素作用的分子机理、植物与环境、病虫互作的分子机理、植物生物技术与分子育种等。