Longitudinal virological changes and underlying pathogenesis in hospitalized COVID-19 patients in Gu

来源 :中国科学:生命科学(英文版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:xulei25163974
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Prolonged viral RNA shedding and recurrence of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) in coronavirus disease 2019 (COVID-19) patients have been reported.However,the clinical outcome and pathogenesis remain unclear.In this study,we recruited 43 laboratory-confirmed COVID-19 patients.We found that prolonged viral RNA shedding or recurrence mainly occurred in severe/critical patients (P<0.05).The average viral shedding time in severe/critical patients was more than 50 days,and up to 100 days in some patients,after symptom onset.However,chest computed tomography gradually improved and complete absorption occurred when SARS-CoV-2 RT-PCR was still positive,but specific antibodies appeared.Furthermore,the viral shedding time significantly decreased when the A1,430G or C12,473T mutation occurred (P<0.01 and FDR<0.01) and increased when G227A occurred (P<0.05 and FDR<0.05).High IL1R1,IL1R2,and TNFRSF21 expression in the host positively correlated with viral shedding time (P<0.05 and false discovery rate <0.05).Prolonged viral RNA shedding often occurs but may not increase disease damage.Prolonged viral RNA shedding is associated with viral mutations and host factors.
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