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采用组织分离法,从9个不同地区银杏(Ginkgo biloba L.)的根、茎、叶组织中分离内生真菌,再利用形态学特征与菌株ITS rDNA序列分析相结合的方法鉴定分离菌株。结果表明:从根、茎、叶组织中共分离出78株内生真菌,分属10个属。其中,Alternaria,Fusarium,Colletotrichum,Phomopsis为优势菌群,分别占总菌株数的24.3%、20.5%、16.7%和14.1%;优势菌群在银杏各部位均有分布,无明显的组织特异性。银杏根、茎、叶中均存在特有内生真菌种类,不同采集地