【摘 要】
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丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)属于黄病毒科丙型肝炎病毒属,其基因组为单股正链RNA,全长约9.6 kb.基因组编码一个多聚蛋白,通过酶解可将该多聚蛋白裂解为10种功能蛋白,包括位于氨基端的3种结构蛋白:病毒核心蛋白(C)、包膜蛋白1(E1)和包膜蛋白2(E2),以及位于羧基端的7种非结构蛋白(non-structural protein):P7、NS2、NS3、NS4A
【机 构】
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100021北京市朝阳区疾病预防控制中心,100021北京市朝阳区疾病预防控制中心,100021北京市朝阳区疾病预防控制中心,100021北京市朝阳区疾病预防控制中心
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丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)属于黄病毒科丙型肝炎病毒属,其基因组为单股正链RNA,全长约9.6 kb.基因组编码一个多聚蛋白,通过酶解可将该多聚蛋白裂解为10种功能蛋白,包括位于氨基端的3种结构蛋白:病毒核心蛋白(C)、包膜蛋白1(E1)和包膜蛋白2(E2),以及位于羧基端的7种非结构蛋白(non-structural protein):P7、NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B[1].其中NS5B为RNA聚合酶,与HCV基因组的复制密切相关.由于病毒RNA聚合酶缺乏校对纠错功能,以及HCV为适应宿主环境和逃避宿主的免疫监视作用,HCV的基因组核苷酸序列存在较高的变异心],每个位点核苷酸变异频率约10-3.笔者选取了GenBank中公开发表的中国46株HCV全基因序列,对其核苷酸序列进行比对、聚类等分析,描述了中国HCV的核苷酸序列特征。
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