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目前我国医疗机构药品价格虚高,其主要原因与医药体系不完善这个大背景分不开。医药分开作为"新医改"下的发展方向,有其必要性,对减少医院浪费、改善医疗服务、解决药品流通秩序混乱问题有良性效应。但是,实行医药分开还存在现实困境,在医院运营、药品质量与安全以及医药利益链等方面还需要思考,针对以上问题,讨论了处理医药分开现实困境的措施。