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对采自麻栗坡县的晋通马矮马各3匹的材料,所用20种限制性内切酶中,有16种可产生切点,平均每个个体获得56条限制性片段。与其它家畜家一不同,家马有高度的mtDNA多态性,6匹马均有自己独特的mtD-NA基因型,提示该地家马可能为多起源,至少有多重母系,这些母系可追溯到1~10万年前,与化石记载相一致。本次实验未找到将两种马区分开的特异性多态标记,这可能是同栖于同一生态环境中,相互交配,血液相融,而不是各自起源于自己原母系。由于所测样本数较少,尚不能得到区分两种马的一个统计学上的规律性来。云南地理地貌十分复