中华绒螯蟹内源性白斑综合症病毒基因EjsWSSV的克隆与鉴定

• 作 者: 解文利 李鹏 靳芳草 周开亚
• 机 构: 南京师范大学生命科学学院
• 出 处: 南京师大学报：自然科学版
• 发表日期: 2012年4期
• 关键词: 中华绒螯蟹 白斑综合症病毒 CDNA末端快速扩增 CDNA克隆 序列分析 Eriocheir iaponica sinensis WSSV. RACE cD
• 基金项目: Jiangsu Province Basic Research Program（ Natural Science Foundation Funded Project（ BK2010541 ） ）.

基于已获得的表达序列标签序列，应用RACE技术从中华绒螯蟹基因组中获得了一个白斑综合症病毒基因（Ey,WSSV）的全长cDNA序列，全长为3864bp并包含一个3732bp的开放阅读框，编码一个138．25kDa的含1243个氨基酸的多肽，编码的氨基酸序列包含一个VWA结构域．通过序列比对、序列结构比较和一些生物信息学预测分析，表明EjsWSSV蛋白序列与白斑综合症病毒基因组的ORF16具有高同源性，它不含有信号肽和跨膜区，为非分泌型和α-螺旋型蛋白，可能定位于细胞质．通过PCR检测验证，EjsWSSV基