【摘 要】
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目的 通过生物信息学分析PDZ结合激酶/T-淋巴因子激活的杀伤细胞来源的蛋白激酶(PBK/TOPK)在乳腺癌(BRCA)中的表达及临床意义,并预测其潜在的分子通路和生物学功能.方法 挖掘
【机 构】
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530021 南宁,广西医科大学组织学与胚胎学教研室;530021 南宁,广西医科大学第一附属医院神经外科;530021 南宁,广西医科大学基础医学中心实验室
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目的 通过生物信息学分析PDZ结合激酶/T-淋巴因子激活的杀伤细胞来源的蛋白激酶(PBK/TOPK)在乳腺癌(BRCA)中的表达及临床意义,并预测其潜在的分子通路和生物学功能.方法 挖掘Oncomine数据库分析PBK/TOPK信使核糖核酸(mRNA)在不同癌症中的表达情况.下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库BRCA和正常乳腺组织的RNA测序数据和临床信息,分析PBK/TOPK mRNA表达与临床特征的相关性.应用Kaplan-Meier Plotter数据库进行生存分析.通过筛选PBK/TOPK相关基因,并进行功能富集分析,预测PBK/TOPK在BRCA中的潜在分子通路和生物学功能.结果 PBK/TOPK基因在BRCA组织中的表达显著高于正常乳腺组织(P<0.05),并与雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)、三阴性乳腺癌(TNBC)和绝经状态存在关联性(P<0.05).生存分析结果显示,PBK/TOPK基因高表达提示BRCA预后不良(P<0.05).功能富集分析显示PBK/TOPK相似基因主要涉及BRCA细胞分裂、细胞周期调节和微管细胞骨架形成等生物功能,参与BRCA细胞周期等信号通路.结论 PBK/TOPK mRNA在BRCA组织中高表达,与BRCA患者预后不良密切相关,可能是BRCA潜在的生物标志物和治疗靶标.
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