【摘 要】
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为了深入挖掘隐性白羽洛克鸡RNA-Seq的数据信息,进一步完善隐性白羽洛克鸡的基因组注释情况,试验采用生物信息学方法对120日龄隐性白羽洛克鸡RNA-Seq的5 082 036 200 bp的高
【机 构】
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海南省农业科学院畜牧兽医研究所; 海南大学动物科技学院; 华南农业大学; 东华理工大学; 文昌龙泉文昌鸡实业有限公司;
【基金项目】
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海南省重点研发计划项目(ZDYD2019070);现代农业产业技术体系建设专项(CARS-41-Z17)
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为了深入挖掘隐性白羽洛克鸡RNA-Seq的数据信息,进一步完善隐性白羽洛克鸡的基因组注释情况,试验采用生物信息学方法对120日龄隐性白羽洛克鸡RNA-Seq的5 082 036 200 bp的高质量序列数据进行了单核苷酸多态性(SNP)查找、可变剪接(AS)筛查、基因结构优化和新转录本预测研究。结果表明:数据挖掘得到103 926个可靠的SNP位点,29 525个可变剪接, 10 403个优化基因,预测到新转录本798个。说明该研究结果能够进一步完善隐性白羽洛克鸡基因组注释情况,并可丰富其SNP数据和可变剪切数据。
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