基于重启随机游走算法的生物信息学关联预测模型

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本文提出了基于重启随机游走算法的预测模型(RWRCMF)经实验证明可以高效地预测人类miRNA与自身疾病之间的潜在关联。首先,在数据预处理阶段,本文针对疾病的语义相似性和miRNA的功能相似性运用重启随机游走算法得到二者的拓扑网络相似性。其次,利用加权K最近邻(WKNKN)算法降低了已知miRNA-疾病关联矩阵的稀疏性,再通过高斯核函数计算得出miRNA和疾病各自的高斯核相似性。最终通过协同矩阵分解完成目标函数的构造得到miRNA-疾病之间的关联预测得分。最终模型经过机器学习中的留一交叉验证和五折交
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