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土壤含锌量低和土壤缺有效锌失去平衡是缺锌的主要原因。吉林省大部分耕地，特别是中西部地区黑土、黑钙土、淡黑钙土、石灰性草甸土、盐碱土等，土壤有效锌含量低，属缺锌或潜在缺锌土壤；农业集约化程度提高，氮磷化肥用量增加，人为调节锌素营养不良，导致锌素营养入不抵出，打破了土壤中原来的锌量的平衡；大量磷肥的施入，降低了土壤锌的有效性，也将导致出现缺锌症状。