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目的研究草珊瑚的遗传多样性及不同种源之间的遗传关系，为保护种质资源奠定基础。方法采用ISSR分子标记对8个种源共51个草珊瑚样品进行了DNA分子水平的分析评价，用Popgen32软件计算遗传多样性和遗传距离，通过UPCMA法进行聚类分析。结果筛选出10条多态性ISSR引物用于草珊瑚不同样品的ISSR—PCR，检测得到111个位点，其中106个为多态性位点，约占95．50％。草珊瑚不同种源间遗传距离在0．0347～0．1850。8个种源总遗传多样性主要来自种源内遗传变异，种源间分化指数Gst=0．3403。