普城沙雷氏菌pigX基因的生物信息学分析

• 作 者: 吴岩 邱旭华 刘晓光
• 机 构: 江苏大学食品与生物工程学院,江苏大学生命科学研究院
• 出 处: 江苏农业学报
• 发表日期: 2017年3期
• 关键词: 普城沙雷氏菌 GGDEF/EAL结构域 pigX基因 生物信息学 Serratia plymuthica GGDEF/EAL domain pigX gene
• 基金项目: 国家自然科学基金项目（31240046）,公益性行业（农业）科研专项（201503110-12）

通过生物信息学方法对普城沙雷氏菌（Serratia plymuthica）G3菌株中GGDEF/EAL结构域蛋白编码基因pigX启动子区域的调控信息以及编码蛋白质的理化特性和结构特点进行了解析。利用启动子分析软件Soft-berry和Neural Network Promoter Prediction对pigX基因编码区上游序列进行启动子预测,利用生物信息学方法对PigX蛋白的氨基酸组成和理化特性、磷酸化和糖基化位点、跨膜结构、信号肽二级结构和保守结构域等进行预测分析。结果显示：pigX启动子区有Fur和