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目的 明确肺结核患者和健康人群的呼吸道微生物菌群组成的变化情况.方法 时间限定为2010年1月至2019年12月,在英文数据库(PubMed、Embase and Ovid、Web of Science、Google Scholar、Cochrane Library)和中文数据库(中国知网、万方、中国生物医学文献服务系统与维普)检索所有包含结核和呼吸道菌群的文献,按照文献检索流程筛选文献并最终纳入.收集所有可用的下一代测序数据,统一处理参数,进行数据预处理和系统的宏基因组学分析及统计学处理.结果 共纳入9篇英文文献.物种分析结果提示肺结核组和健康对照组在门水平相对丰度排在前10位的共有菌群有:厚壁菌门、OD1菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门、梭杆菌门、蓝菌门.但两组呼吸道菌群群落结构组成差异有统计学意义,α多样性分析显示,肺结核组观测到的可操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)数目(286.60±22.82)、Faith谱系多样性(phylogenetic diversity,PD)指数(Faith PD指数)(13.57±2.58)、Shannon指数(7.17±0.24)明显高于健康对照组(分别为42.88±2.49、6.52±0.22、4.42±0.07),差异均具有统计学意义(P值分别为0.00016、0.00056、0.00016).肺结核组Chao1指数高于健康对照组(266.50±92.71和38.44±2.86),但差异无统计学意义(P＞0.05).门水平上两组丰度有差异的物种有6种,其中5种在健康对照组聚集,为厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门、梭杆菌门、变形菌门,另有OD1门在肺结核组聚集.F16科、丙型变形菌纲、梭杆菌门梭杆菌目、厚壁菌门下的明串珠菌科和芽孢杆菌科是肺结核特有的菌群种类.结论 肺结核患者与健康人群比较,呼吸道菌群的多样性及物种组成均发生了较大变化,并具有特有的菌群种类.