竹叶花椒ZaGGPPS基因克隆与表达分析

• 作 者: 关淑文 王毅 郝佳波 原晓龙 陆斌 李贤忠
• 机 构: 西南林业大学林学院,云南省林业和草原科学院
• 出 处: 广西植物
• 发表日期: 2021年4期
• 关键词: 竹叶花椒 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶 克隆 生物信息学分析
• 基金项目: 国家自然科学基金(31860177),云南特色经济林新种质创新与利用(2018BB008)。

为了揭示竹叶花椒萜类代谢的分子机理及嫁接对其风味的影响,该文依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)基因的全长cDNA序列,命名为ZaGGPPS,并利用NCBI、ProParam、SignalP 4.1 server、DNAMAN和MEGA 7.0软件对ZaGGPPS基因进行生物信息学分析,并比较其在嫁接树和实生树中的表达量。结果表明:ZaGGPPS包含完整的cDNA开放阅读框(OF