沙眼衣原体多形态膜蛋白D基因序列分析及其B细胞抗原表位预测

• 作 者: 刘光桥 宋立华 邱少富 端青
• 机 构: 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室
• 出 处: 微生物学免疫学进展
• 发表日期: 2008年3期
• 关键词: 沙眼衣原体 多形态膜蛋白D 二级结构 B细胞表位 预测 Chlamydiat rachomatis Polymorphie membrane protein

分析沙眼衣原体多形态膜蛋白D（PmpD）的基因序列并预测PmpD蛋白的B细胞抗原表位。在GenBank中检索沙眼衣原体不同血清型的PmpD基因序列，进行序列比对分析。以L2血清型PmpD基因序列为材料，采用Karplus-Schulz、Chou-Faaman和Gamier-Robson方案预测蛋白质的二级结构和柔性区；按Jamesonv-wolf方案预测抗原指数，运用Kyte-Doolittle方案预测PmpD氨基酸的亲水性，利用Emini方案预测蛋白质的表面可及性。检索到20个沙眼衣原体不同菌株的Pmp