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1．容易滋生学术腐败与开展不正当竞争。一般医学院校科研经费的来源途径有三种：上级政府拨款、地方科学基金资助、医药企业联合研究经费。拨款与资助取得的科研经费大部分是靠上级主管部门审批获得，就市场经济理论来讲，这是一个“卖方市场”，在课题申报过程中容易出现“跑课题”、“跑经费”现象，同时也容易出现“钱权交易”，滋生腐败。而企业研究经费较多与医学院校的科室负责人使用的药品种类和数量有关，尤其与医院的临床医学研究人员有关，容易造成医药企业之间的不正当竞争。