【摘 要】
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目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选调控子宫颈癌发生发展的遗传突变基因,并探讨突变基因的临床价值。方法从TCGA数据库下载子宫颈癌相关单核苷酸多态性数据和表达谱数
【机 构】
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右江民族医学院1.附属医院生殖医学中心,基础医学院
【基金项目】
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国家自然科学基金(31860313),百色市科学研究与技术开发计划(20170505)。
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目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选调控子宫颈癌发生发展的遗传突变基因,并探讨突变基因的临床价值。方法从TCGA数据库下载子宫颈癌相关单核苷酸多态性数据和表达谱数据。通过R软件进行差异表达分析。通过DAVID软件对差异表达基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并使用String和Cytoscape进行蛋白网络互作分析。筛选与蛋白表达水平相关的突变基因并绘制生存曲线。结果GO和KEGG富集分析显示突变基因负调控RNA聚合酶Ⅱ启动子区域、参与Notch信号通路及
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