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抗生素耐药性在细菌病原体中不断出现并蔓延,其遗传物质基础抗生素耐药基因(ARG)可通过基因突变或水平基因转移等方式获得,并赋予宿主对抗生素的耐药性,从而严重威胁人类的健康。人类肠道菌群作为ARG产生和传播的重要场所越来越受到重视。人类肠道菌群含众多种类的ARG,可通过水平基因转移等方式实现ARG的传播。影响肠道菌群中ARG产生和传播的因素包括抗生素、非抗生素类药物、母婴传播、食物和饮水等。肠道菌群中ARG的检测方法有抗生素耐药菌株的分离培养、定量PCR、微阵列分析、宏基因组测序、功能性宏基因组和单细胞全基