【摘 要】
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发展了应用于鸟嘌呤G和氨基酸残基体系的浮动电荷力场,该力场明确定义了孤对电子和键的电荷和位置,通过电荷随着环境的浮动来体现极化效应;通过氢键拟合函数 k HB 描绘了氢键
【基金项目】
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国家自然科学基金(批准号:21133005,21603091),辽宁师范大学创新实践项目(批准号:cx201801012)资助.
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发展了应用于鸟嘌呤G和氨基酸残基体系的浮动电荷力场,该力场明确定义了孤对电子和键的电荷和位置,通过电荷随着环境的浮动来体现极化效应;通过氢键拟合函数 k HB 描绘了氢键键能.应用量子化学方法,对G与氨基酸残基体系从氢键、几何结构及电荷分布3个方面展开计算及分析,并以其为基准,确定参数发展了适用于G与氨基酸残基氢键体系的ABEEM σπ PFF.采用3种不同力场模拟目标分子的结构和性质.模拟结果表明,发展的ABEEM σπ PFF与量子化学方法具有最好的一致性,可用于模拟生物大分子体系.
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