苏淮猪BMP4基因3’-UTR区克隆和多态性分析

来源 :南京农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:q251208414
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[目的]本试验旨在研究梅山猪和苏淮猪BMP4(bone morphogenetic protein 4)基因3’-UTR区序列特征,分析苏淮猪BMP4基因3’-UTR区SNP位点并了解苏淮猪和高繁殖力猪种梅山猪BMP4基因3’-UTR SNP位点多态性.[方法]采用克隆测序技术获得苏淮猪BMP4基因3’-UTR区序列;利用生物信息学方法分析其序列特征;利用池DNA测序技术筛选SNPs,采用AS-PCR技术分析苏淮猪和梅山猪SNPs位点多态性.[结果]苏淮猪BMP4基因3’-UTR区序列长度为267 bp,含有一个(AC)9微卫星位点和PolyA结构;在苏淮猪BMP4基因3’-UTR区20 nt处发现一个SNP,AS-PCR检测到3种基因型(GG、GC和CC);在苏淮猪中,GG型和G等位基因为优势基因型和优势等位基因,频率分别为0.815和0.887,而在高繁殖力猪种梅山猪中CC型和C等位基因为优势基因型和优势等位基因,频率分别为为0.667和0.770.[结论]获得了BMP4基因3’-UTR区序列,鉴定了一个新的SNP位点,发现BMP4基因3’-UTR区20G>C位点多态性可能与猪繁殖性能有关.
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