全外显子组测序联合SnaPshot技术分析华南地区汉族人增生性糖尿病视网膜病变的遗传易感性

• 作 者: 谢洁 蒋正轩 张良 崔颖 王军 张爱平 孟倩丽
• 机 构: 510080 广州，华南理工大学附属广东省人民医院眼科,230022 合肥，安徽医科大学第二附属医院眼科,510080 广州，广东省人民医院眼科 广东省眼病防治研究所 广东省医学科学院,510080
• 出 处: 中华实验眼科杂志
• 发表日期: 2018年36期
• 关键词: 增生性糖尿病视网膜病变 汉族 遗传易感性 外显子组测序 SNAPSHOT Proliferative diabetic retinopathyHan natio

目的

研究增生性糖尿病视网膜病变(PDR)的遗传易感性。

方法

采用横断面研究设计，纳入2011年9月至2012年2月在东莞眼病研究中确诊的2型糖尿病患者和2017年7月至2018年3月在广东省人民医院眼科诊治的相关患者共220例，其中100例糖尿病患者和120例PDR患者。采用全外显子组测序技术对22例不伴视网膜病变的2型糖尿病患者(糖尿病组)和23例PDR患者(PDR组)的外周血样本DNA进行单核苷酸多态性(SNP)、InDel等鉴定，筛选出其中具有显著差异的9个外显子区域位点，采用SnaPshot技术对78例不伴视网膜病变的2型糖尿病患者和97例PDR患者进行9个位点的SNP分型，并分析其单倍型和连锁不平衡性。

结果

全外显子组测序检出75个位点SNP与PDR相关联(P<0.01)，涉及53个基因，其中11个位点位于外显子区，7个突变属于非同义突变。SnaPshot SNP分型技术验证其中9个显著差异的位点，发现其等位基因及基因型频率在PDR组和糖尿病组中差异无统计学意义(P>0.05)，但7种单倍型分布频率差异有统计学意义(P<0.01)，其中Hap1和Hap4可能会降低PDR的患病风险[均比值比(OR)<1，P<0.05)]，Hap2可能会增加PDR的患病风险(OR>1，P<0.05)。

结论

华南地区汉族2型糖尿病患者PDR的发生存在遗传易感性。