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依次采用DEAE-纤维素、肝素-Sepharose,酷蛋白-Sepharose和羟基磷灰石层析将大鼠酷蛋白激酶Ⅱ纯化了2486倍,回收率9.5%。SDS-PAGE表明CKⅡ由三个不同亚基组成,分子量分别是37,35和26KD。该激酶利用酷蛋白为底物,Ca^2+,Ca^2+-磷脂酰丝氨酸的cAMP对CKⅡ的活性无影响,而肝素对该酶的活性有抑制作用。