基于富集分析的乳腺癌发病相关通路探讨

• 作 者: 葛杰 贾月辉 李继媛 王琪 韩云峰 谢志平 杨晓蕾 郑毅
• 机 构: 齐齐哈尔医学院流行病与卫生统计学教研室,齐齐哈尔医学院实验教学中心,齐齐哈尔医学院免疫学教研室,齐齐哈尔医学院预防医学教研室,齐齐哈尔医学院全科医学教研室
• 出 处: 系统医学
• 发表日期: 2020年11期
• 关键词: 富集分析 乳腺癌 通路分析 Enrichment analysisBreast cancerPathway analysis
• 基金项目: 黑龙江省教育厅面上项目(2016-KYYWF-0885)

目的从通路水平探讨乳腺癌发病的相关基因。方法使用i-GSEA4GWASv2和ICSNPathway对GRASPv2.0中乳腺癌的GWAS数据进行基因富集分析,有意义的GO通路依照GO数据库注释构建有向无环图。结果与乳腺癌发生有关的4条通路:小GTP酶介导的信号转导(P平均=0.002;FDR平均=0.017)、GnRH信号通路(P_(平均)=0.005;FDR_(平均)=0.041)、MAPK信号通路(P_(平均)=0.001;FDR_(平均)=0.026)、长时程增强通路(P_(平均)=0.002;FD