鸡粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)基因的克隆及生物信息学分析

• 作 者: 于航 高冬妮 葛菁萍 刘颖 赵思思 平文祥
• 机 构: 黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室
• 出 处: 中国农学通报
• 发表日期: 2018年36期
• 关键词: GM-CSF 生物信息学 结构预测 基因克隆
• 基金项目: 国家自然科学基金“表达IBDV主要保护性抗原的重组杆状病毒构建及其作为疫苗的免疫效果研究”(No.31270143);黑龙江省高等学校科技创新团队“农业微生物发酵技术”(No.2012td009)

为了解GM-CSF的基因及蛋白质特性,本研究以pUC-GM-CSF为模板,根据GenBank中登录的GM-CSF序列设计引物扩增GM-CSF基因,随后将其克隆至pMD18-T载体,并对鉴定正确的重组质粒pT-GM-CSF进行测序分析,然后对GM-CSF基因进行同源性分析、ORF分析、氨基酸序列分析、疏水性分析、磷酸化位点预测、亚细胞定位分析及二级结构预测。结果表明:该基因ORF的全部长度为453bp,能够编码150个氨基酸,并且在GM-CSF基因所编码的蛋白质中有4个丝氨酸和3个苏氨酸可能成为蛋白激酶磷酸