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在赣南18个县(市、区)收集到508份柑桔溃疡病菌样品,采用已报道的柑桔溃疡病菌A菌系306菌株(GenBankAccessionno.AE008923)基因组上的14个SSR位点分析遗传多样性。从14个SSR位点中,筛选出用于赣南地区溃疡病菌种群多样性研究的SSR位点7个(XL1、XL2、XL3、XL4、XL5、XL8和XL7),测试得到的Nei’s基因多样性指数在0.66-O.83之间。通过这7个位点分析赣南不同地域的样品发现,大余县样品的遗传多态性最高,定南县样品的遗传多态性最低。采用Structu