【摘 要】
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本研究利用表达谱芯片技术解析了低温胁迫初期(0-120min)不同低温处理时间草菇转录组水平的变化.芯片结果分析发现在低温诱导过程中,低温处理20min内变化基因的功能为单加氧
【机 构】
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上海市农业科学院生物技术研究所 上海201106;上海市农业遗传育种重点实验室 上海201106;上海市农业科学院生物技术研究所 上海201106
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本研究利用表达谱芯片技术解析了低温胁迫初期(0-120min)不同低温处理时间草菇转录组水平的变化.芯片结果分析发现在低温诱导过程中,低温处理20min内变化基因的功能为单加氧酶、氧化还原酶和细胞内的氧化还原.低温处理40min时表达差异基因具有结合RNA的功能.80min的时间段内,基因的功能比较集中于核酸物质和能量的代谢.CYP450的代谢途径在20-40min、60-80min和100-120min低温处理的菌丝体中均有显著性变化,表明这一通路在草菇低温处理过程中表现活跃.基因表达趋势分析发现34个表达差异基因富集到显著表达趋势模型,基因共表达网络分析发现VVO_04066位于网络的核心地位,推测VVO_04066通过提高磷酸肌醇特异性磷脂酶C(PI-PLC)的胞内水平,促进糖蛋白和几丁质的合成,从而完成草菇细胞的低温胁迫应答.
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