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集体所有制科研单位是城市体制改革中产生的新事物。本文在全面分析集体所有制科研单位“独立核算、自负盈亏”性质的基础上,阐明在选择经济效果评价方法时应考虑的三点因素:资金的时间价值、投资的风险价值及复杂劳动的价值。进而确定其经济效果评价必须采用动态评价方法,并以海华新技术开发中心“大型旋转机械的故障诊断系统”为例,系统阐述了动态评价方法的应用。