3种PCR程序扩增甜菜SSR及InDel标记的比较

• 作 者: 刘乃新 刘蕊 吴玉梅 吴则东
• 机 构: 黑龙江大学农作物研究院,哈尔滨师范大学生命科学与技术学院
• 出 处: 中国农学通报
• 发表日期: 2018年30期
• 关键词: TOUCH DOWN PCR 梯度PCR 固定退火温度PCR SSR标记 INDEL标记 Touch down PCR gradient PCR fixed a
• 基金项目: 国家现代农业产业技术体系（糖料）建设专项资金资助（CARS-17-0503）, 农业行业标准《甜菜等级规格糖料甜菜》（181721301092371116）, 农业行业标准制定和修订《甜菜种子贮藏技术规程》（181821301092371022）, 农业农村部种子管理局项目《甜菜登记品种分子数据库建设与完善》（111821301092361010）

本研究旨在扩增出条带清晰、非特异性条带少的SSR/InDel标记产物。选择来自6个国家的12份不同基因型甜菜品种,利用SSR及InDel两种标记方法,Touch-down PCR、梯度PCR及常规固定退火温度PCR三种反应程序扩增产物。通过比较扩增产物的多态性、稳定性、清晰度选择适合两种分子标记方法的PCR反应程序。结果表明：Touch-down PCR法可以通过一次反应即顺利扩增出带型清晰,无无效带,扩增效果稳定的样本产物。梯度PCR法扩增结果不稳定,有非特异性条带出现并且弥散现象严重。固定退火温度PC