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45SrDNA和5SrDNA是水稻中与核糖体RNA合成有关的2个功能片段，有关这2个序列在水稻染色体上的位置，不同研究者的研究结果不尽相同，在获得水稻染色体清晰制片的基础上，通过FISH确定了45SrDNA序列位于水稻的第9号和第10号染色体的短臂末端，并且第9号染色体上的拷贝数多于第10号染色体，5SrDNA序列位于第11号染色体短臂靠近着丝点处。