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基因组印迹使来自父方和母方的基因虽核苷酸组成相同但具不同活性,这种差异起始于配子形成过程。被印迹者不表达或表达活性低。至少部份基因在精子或卵子形成过程中被印迹,来自父方或母方的该基因在后代体细胞中保持“沉默”。亲代双方基因组由于印迹分布形式不同而在胚胎发育中具不同功能,两者的正常互补为胚胎正常发育所需。甲基化修饰为基因组印迹的主要形式。