利用全基因组重测序分析鹿茸重量相关基因

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茸角是鹿科动物特有的器官,具有重要的生物学意义。鹿茸生长是一个复杂的生物代谢过程,其重量与遗传因素有一定关联。本研究对饲养条件基本一致的5个梅花鹿(Cervus nippon)群体进行调查,获得高产和低产梅花鹿个体共100只,利用全基因组重测序分析这些个体与鹿茸重量相关的遗传变异。结果表明,共得到94个与鹿茸重量可能相关的遗传变异,其中有2个变异位点分别定位于OAS2和ALYREF/THOC4基因的外显子区,且ALYREF/THOC4基因在鹿茸中表达量很高。功能富集分析发现,这些遗传变异与鹿茸生长发育密切相关,可作为潜在的鹿茸重量相关遗传变异。本研究首次通过全基因组重测序直接筛选与鹿茸重量相关的遗传变异,并分析关联基因的生物学功能,对揭示鹿茸生长发育和鹿茸重量差异形成的遗传机制具有重要意义。 Antler antler is a unique organ, has important biological significance. Antler growth is a complex biological metabolic process, the weight and genetic factors are related. In this study, five populations of Cervus nippon, which were basically the same as farmed, were investigated. 100 high-yielding and low-yielding sika deer individuals were obtained, and genetic variation of antler weight was analyzed by genome-wide recombination. The results showed that there were 94 genetic variations that may be related to the weight of pilose antlers, of which 2 were located in the exon of OAS2 and ALYREF / THOC4 genes, respectively, and the ALYREF / THOC4 gene was highly expressed in pilose antlers . Functional enrichment analysis found that these genetic variations are closely related to the growth and development of velvet antlers, and may be used as potential weight-related genetic variations in antler velvet. This study, for the first time, directly screened genetic variation related to weight of antler by genome-wide recombination and analyzed the biological function of related genes, which is of great significance to reveal the genetic mechanism of antler growth and weight variation.
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