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2003年4月，国务院批准航天育种工程立项，由农业部、航天科技集团公司、国际科工委和解放军总装备部等部门共同组织实施。航天育种工程项目的实施分为两个阶段第一阶段为育种卫星发射工作，包括火箭、卫星的研制，装载材料的征集遴选，育种卫星的发射、测试和回收等；第二阶段为地面育种工作，包括地面育种设施建设、地面育种试验，航天育种机理研究及产业化基地建设等。