【摘 要】
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目的 探究2个来自非脱羧勒克菌的多药耐药(MDR)质粒p707804?CTXM和pP12375?CTXM的耐药机制.方法 采用16S rDNA基因扩增初步鉴定菌种,得到测序数据后进行平均核苷酸一致性(ANI
【机 构】
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贵州医科大学基础医学院,现代病原生物学特色重点实验室,贵阳 550025;军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所,病原微生物生物安全国家重点实验室,北京 100071
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目的 探究2个来自非脱羧勒克菌的多药耐药(MDR)质粒p707804?CTXM和pP12375?CTXM的耐药机制.方法 采用16S rDNA基因扩增初步鉴定菌种,得到测序数据后进行平均核苷酸一致性(ANI)比对最终核定菌种;全自动细菌鉴定及药敏分析系统检测细菌的MIC值;随后进行全基因组测序,获得细菌的全基因组序列,通过RAST、BLASTP/BLASTN、ResFinder和ISfinder等进行精细注释及比较基因组学分析确定耐药基因所在基因环境,阐明耐药移动元件的进化与传播历程.结果 非脱羧勒克菌150707804和P12375分别携带质粒p707804?CTXM和pP12375?CTXM,均编码超广谱β?内酰胺酶(ESBL).这两个质粒均只包含一个MDR区,p707804?CTXM含有β?内酰胺类、氨基糖苷类、氯霉素类、利福平类和磺胺类耐药基因,pP12375?CTXM含有除利福平类以外的上述所有耐药基因.p707804?CTXM的MDR区为新型转座子Tn6810,为Tn1696衍生物,由新型整合子In1684插入至Tn1696骨架而产生.blaCTX?M?3位于ISEcp1介导的转座元件Tn6502(ISEcp1?blaCTX?M?3?orf477)中;pP12375?CTXM的MDR区插入在orf531中,由Tn6322、ISKpn25、IS1R、In609、IS26和ΔISPa38构成,blaCTX?M?9由ISCR介导,位于In609的3′?CS下游.结论 p707804?CTXM和pP12375?CTXM均携带多种耐药基因,介导相应菌株的多药耐药.其中blaCTX?M由ISEcp1?blaCTX?M?orf477或ISCR介导并插入至整合子或转座子内.该研究中,p707804?CTXM是非脱羧勒克菌中携带blaCTX?M?3的首个测序质粒.
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