青岛地区2008—2011年柯萨奇病毒A组16型流行及VPl基因特征

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:war_and
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目的 阐明2008—2011年青岛地区手足口病(hand,foot,andmouthdisease,HFMD)相关柯萨奇A组16型病毒(CoxsackievirusA16,CAl6)流行情况及VPl基因特征。方法首先采用荧光RT—PCR法对HFMD患者咽拭子标本进行总肠道病毒(enterovirus,EV)、柯萨奇病毒A组16型(CAl6)和人肠道病毒71型(humanenterovirus71,EV71)检测;对CAl6阳性的标本进行病毒分离培养,选取阳性分离株的代表株进行VP1基因全长序列的扩增及基因序列测定,并与GenBank中的CAl6代表株进行核苷酸和氨基酸的同源性和亲缘性分析。结果2008—2011年青岛地区CAl6在HFMD相关肠道病毒中所占比例分别为39.O%、10.6%、46.9%和2.O%。46株CAl6病毒VPl基因核苷酸和氨基酸的差异性分别为11.0%和2.O%。所有VPl序列在进化树上可分为2个分支,分别属于B1a亚型和B1b亚型。2008—2011年间CAl6分离株中B1a亚型与B1b亚型的数量分别为9/7、7/1、3/11和2/6。结论2008—2011年CAl6青岛地区每两年出现一次流行高峰,B1a和B1b两个亚型一直共循环流行,2009年与2010年分别以B1a亚型和B1b亚型为优势流行,至2011年CAl6在HFMD的病原谱中检出率极低。

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